From: Identification of three new cis-regulatory IRF5 polymorphisms: in vitro studies
Haplotypeb | % | rs4731530 | rs2402941 | rs6968225 | rs6968508 | rs4728141 | rs729302 | rs2402940 | rs754281 | rs11768806 | rs4728142 | rs1874330 | rs3778754 | rs3757388 | rs3757387 | rs3757385 | rs3807135 | rs2004640 | rs3807307 | rs752637 | rs3823536 | rs3778753 c | rs3807306 | EXON 6 INDEL | rs10954213 | rs13242262 | rs10488630 | rs10488631 | rs2280714 | rs4731535 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
4 | 24.7 | C | G | C | C | C | A | C | C | C | A | T | G | A | C | G | C | T | C | C | A | G | T | A | A | T | G | T | T | T |
4 | 1.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | - | - |
4 | 3.2 | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
na | 1.6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
5 | 3.2 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - |
6 | 6.8 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | - | A | C | - | C |
6 | 2.6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | - | A | C | - | C |
na | 1.6 | - | - | - | - | T | - | - | - | - | G | - | - | - | T | - | - | - | - | T | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - |
na | 1.6 | T | - | - | - | T | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
na | 2.6 | - | - | - | - | T | - | - | - | - | G | - | C | - | T | - | - | - | T | - | G | A | G | G | G | A | A | - | - | C |
na | 1.1 | - | - | - | - | T | - | - | - | - | G | - | C | - | T | - | - | - | T | T | G | A | G | G | G | A | A | - | - | C |
3 | 7.9 | T | A | G | G | T | - | T | T | T | G | C | C | G | T | T | T | G | T | T | G | A | G | G | G | A | A | - | C | C |
3 | 1.1 | T | A | G | G | T | - | T | - | - | G | - | C | G | T | T | T | G | T | T | G | A | G | G | G | A | A | - | C | C |
3 | 2.6 | T | - | - | - | - | - | T | T | T | G | C | C | G | T | T | T | G | T | T | G | A | G | G | G | A | A | - | C | C |
2 | 7.9 | T | - | - | - | T | C | - | - | - | G | - | C | G | T | T | T | G | T | T | G | A | G | G | G | A | A | - | C | C |
2 | 1.1 | T | - | - | - | T | C | - | - | - | G | - | C | G | T | T | T | G | T | T | G | A | G | G | G | A | A | - | C | C |
2 | 3.2 | - | - | - | - | T | C | - | - | - | G | - | C | G | T | T | T | G | T | T | G | A | G | G | G | A | A | - | C | C |
1 | 5.3 | T | - | - | - | T | C | - | - | - | G | - | C | - | T | - | - | G | T | - | G | A | G | - | - | - | A | - | - | - |
na | 3.2 | - | - | - | - | T | C | - | - | - | G | - | C | - | T | - | - | G | T | - | G | A | G | - | - | - | - | - | - | - |
na | 3.2 | T | - | - | - | T | C | - | - | - | G | - | C | G | T | T | T | G | T | T | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - |